第4章：新纪元的开始
还不知道妻子法里斯已遭遇不幸的田纳西心急如焚，冒险将契约号降至最低轨道高度，终于与丹尼尔斯取得了联系。在得知妻子已经死亡后，他悲痛不已，但职责在身让他必须尽快想办法救援其他队员。在商量过后，田纳西决定使用作业舱将队员带回飞船。
而此时已制造出终极异形的大卫对沃特的表现很失望，沃特拒绝了他的要求。在沃特眼里，人类并不是垂死的物种。道不同不相与谋，既然没有共同的理想，就只有消灭。同时终极异形也开始了杀戮，前来寻找船长布兰森的两名船员被杀死。丹尼尔斯则在大卫的实验室里发现了端倪，肖恩博士并非死于飞船迫降（肖恩的具体死亡情况会在第三部中交待）。大卫见真相败露想置丹尼尔斯于死地，可本应被关闭的沃特突然跳了出来。或许是仿生人在之后的生产中有了许多改进，大卫才没能完全关闭沃特。丹尼尔斯顾不了那么多，趁着沃特阻拦大卫的空档跑了出去，正遇到前来接应的队员。
在庙堂外，作业舱循着丹尼尔斯抛出的闪光器定位器找到着陆地点。丹尼尔斯见沃特走了出来，相信大卫已被关闭。原本十余人的远征队，现在只剩三人。丹尼尔斯和沃特搀扶着另一人登上作业舱，心里总算安定了不少。可田纳西随即从监控中发现有不明生物攀附在舱底，此刻作业舱已经起飞，丹尼尔斯不会允许异形进入契约号。用安全绳将自己连接在作业平台上后，丹尼尔斯举枪四处搜索。在左摇右晃的平台上，根本无法瞄准射击。终极异形甚至还爬到驾驶舱外，险些用头撞碎舷窗。丹尼尔斯孤注一掷，在平台上稳住身形，吸引异形的注意。田纳西趁异形冲向丹尼尔斯的时候，操纵机械抓斗将异形牢牢抓住。再厉害的异形也无法承受机械抓力，被抓斗压成几段扔下了作业舱。
摆脱了危险，作业舱平稳返回到契约号。生活好像又恢复了平静，但其实大家都心照不宣。丹尼尔斯成为新晋船长，下面的任务就是回到原定航线，继续殖民任务。但在当晚就有不明生物出现，丹尼尔斯和田纳西端着枪跑到医疗舱，发现从庙堂返回的第三名船员满身血污倒在地上，胸口有一个大洞。丹尼尔斯急忙命令沃特监控全船，找到异形所在方位。沃特接到命令，面无表情的看着屏幕，犹豫了一下才将方位通报给丹尼尔斯。飞船内传来惨叫声，丹尼尔斯一边指挥沃特按顺序关闭飞船内舱门，一边和田纳西搜索异形。每搜索完一处，就关闭一道闸门，终于找到了异形的下落。
在丹尼尔斯的指挥下，沃特将异形引到了货舱内。丹尼尔斯故技重施，吸引异形冲入车载球形舱。趁异形刹不住脚的时候，丹尼尔斯反身出舱，紧锁舱门。在异形撞破舱门前，飞船出货舱门开启，异形随着球形舱一同坠入冰冷的深空之中。
危机解除，前往Origae-6的旅程即将开始。丹尼尔斯看着田纳西安全的进入休眠状态后，才放心的走向自己的胶囊舱。沃特亲手为她关上舱门，按下休眠按钮。在失去意识前，丹尼尔斯感激的看着沃特的脸，感谢他多次出手相救。此刻丹尼尔斯仿佛找到了精神寄托，愿意和沃特在新的世界建造一间自己的湖边小屋。沃特听到这话眼神游移，好像不明白她所说的意思。丹尼尔斯心里一惊，立刻想到眼前这个失去左手的沃特其实是大卫。可为时已晚，她拼命拍打着舱门都无力阻止席卷而来的困意，慢慢闭上了双眼。
大卫掌控了契约号的一切，作为第一代仿生人和原总裁彼得·维兰德的贴身侍从，他有着对维兰德集团所有资产的控制权。“母亲”毫无保留的听从着大卫的安排，大卫打开殖民者的休眠舱大门，从口中吐出两颗抱脸虫的胚胎，放入保温箱中。七年零四个月后，Oriage-6将会迎来大变化，一个由人工智能与终极生物领导的新纪元。
